脊椎動物胚胎咽側壁的5對囊體。水棲脊椎動物，這5對囊體向外突，在它相應的外胚層部位向內陷，兩者相遇并打通，形成由咽部與外界相通的鰓裂。陸棲脊椎動物用肺呼吸，但在胚胎期也形成5對咽囊，這些咽囊在發育中形成一系列衍生結構：第一對咽囊的遠端部膨大形成中耳鼓室，其近端部仍保留著和咽的聯系，成為耳咽管；第二對咽囊在哺乳類形成腭扁桃體，在其他陸棲脊椎動物多趨于退化；第三、四對咽囊的上皮形成甲狀旁腺（背側）和胸腺（腹側）；第五對咽囊的上皮形成后鰓體，該腺體位于甲狀腺旁，分泌的激素稱降鈣素，其生理作用主要是調節血漿中鈣離子的濃度。咽囊的底面中央處發生出甲狀腺。